编练新军，发展军工企业。
在对外和对内的战争过程中，清朝原有的以八旗和绿营为主的军事体制遭到彻底失败。新式团练湘军、淮军具有较强的战斗力，但装备和管理与外国比还是非常落后。第二次鸦片战争后，西方国家的在华利益已经与清朝政府紧紧维系在一起，所以他们不断建议清朝训练和建立新式军队。同治元年（1862年），由十七名英国军官训练，使用英、俄枪炮组成的两个营和一个炮兵队，开始在直隶练兵，这是中国第一支新式军队。就在奕訢等人努力在外交上获得进展的时候，在镇压太平天国的过程中获得空前实权的地方实力大员，也开始主动寻求在军事装备上学习与追赶外国。李鸿章的淮军也开始采用新式方法进行训练，他在淮军中逐步推广洋枪洋炮，然后聘请外国军官培训军队枪炮阵法，包括口令都用外国口令。这样，在晚清的历史舞台上，最早出现了“练军”这一新式的军队形式。在此后的若干年中，“编练新军”成为清朝政治舞台上经常出现的现象，而这些新军则对以后的历史产生了重要的影响。
李鸿章像
左宗棠像
天津制造局
金陵机器局制造的大炮
由于新式军队对枪炮、轮船的需求量大增，从外国购买价格昂贵而且周转时间太长，所以各省大员们纷纷开始兴办制造枪炮的军事工业。同治二年（1863年）开始，李鸿章先后在上海设立三所洋炮局，同治四年（1865年）合并为金陵机器局。左宗棠也在福建仿造开花炮、无壳抬枪等装备。同治四年，中国第一个规模较大、设备较精的军工企业—江南机器制造总局创办，制造总局内先后增建翻译馆、汽锤厂、枪厂、黑色火药厂和枪子厂，总建设资金超过白银一百万两。在随后的十几年中，江南制造局又增设了炮弹厂、水雷厂、炼钢厂等企业，到19世纪90年代，总投资已经达到了近九百万两白银。虽然所造枪炮在技术上与国外还有近十年的差距，但在中国军事工业近代化的过程中起了非常重要的作用。另外一个大型军工企业是同治五年（1866年）左宗棠在福建期间奏请设立的福州船政局，以建造军舰和火炮为主要任务，先后建造了“万年青号”“镇海号”“扬武号”军舰。更重要的是，左宗棠培养了一批能够自主仿造轮船及轮机、能够按照图纸完成各种工艺的技术工匠。基于此，同治十三年（1874年）他遣散了聘用的所有洋人技师和工匠。到光绪二十年（1894年），福州船政局共造成三十四艘各式轮船，其中有巡洋舰、鱼雷艇等铁甲舰。从全国来看，到甲午战争前，全国各省设立的军工企业已经遍布十八省，达到三十四家。
清朝从入关以来，在政治上采取歧视政策，官职的设置采取满汉双职，满官在汉官之前。而重要的总督、巡抚，则基本上全部是满人担任。但是太平天国起义迫使清朝不得不起用更多的汉族官员来担任要职。同治三年（1864年），在全部十名总督中，有九名是汉人，十五名巡抚则全部是汉人。从咸丰十年到光绪十六年（1860—1890年）的三十年中，清朝总共任命四十四位总督，其中汉人占三十四位；一百一十七名巡抚中，汉人占一百零四位。在奕訢等人的主持下，朝廷建立了比较顺畅的外交体系，各省的大员也积极主动地更新旧式军制和装备，清朝在甲午战争前的三十多年中，军工业的发展道路开始纳入现代化的轨道。与西方列强相比，中国的军事工业虽然还显得非常幼稚、落后，但毕竟走出了传统的冷兵器时代，进入了大规模工业生产的时代。
中国社会科学院近代史研究所研究员马勇
1860年底，恭亲王给朝廷写了《善后六条》（即《通筹夷务全局酌拟章程六条》），这是决定后来几十年的自强运动的一个纲领性文件。它的逻辑关联是什么呢，中国必须建立一支强大的军队，而且还必须从海军开始，因为原来中国是农业文明，没有海军。现在要有海军，要有能掌握海军的人，那么教育就起来了，留学、办新教育、办新学堂，自然而然就发生了；要建立现代化军队，就必须有制造枪炮、船舰的工厂，因此军事工业也自然而然地产生了。
